В целом, есть два варианта с сохранением резинового макета
В стилях CSS (если это возможно на этом вашем викидоте) прописать min-width по всей ширине. Так шапка сайта не будет коллапсировать сама в себя.
Второй вариант - через медиа-запросы прописать группу стилей, в каждом из которых при соответствующей ширине будет ассиметрично прятаться один из элементов шапки. Более изящно, но более сложно.
Отдельную аномалию (про наползание наверх?? даже не про то что прибитый или нет, хотя и про это) представляет футер, но тут с сохранением стилистики может быть более сложное решение с контейнерами внутри контейнеров контейнеров контейнеров. В принципе, я могу попробовать порыться у себя и поискать готовое решение под это (оно вроде как было), но, не уверен, что оно сохранилось и, в целом, глаза не мозолит. Ну то есть, есть нормальный способ с прибиванием и для двухколоночного макета. Но нужно ли? Когда будет побольше времени напишу еще.. Поконкретнее.
В целом, и без этого все хорошо, просто работа над нюансами - дело тоже хорошее.
Насколько свободен викидот в плане кастомизации макетов в ручном режиме?